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現(xiàn)有生物肥都以有機質(zhì)為基礎(chǔ)，然后配以菌劑和無機肥混合而成。為廣泛改善這種一般性生物肥料和傳統(tǒng)性的狀況，生物肥料產(chǎn)品則遠遠超越了現(xiàn)有概念。其將擴大至既能提供作物營養(yǎng)，又能改良土壤;同時還應(yīng)對土壤進行消毒，即利用生物(主要是微生物)分解和消除土壤中的農(nóng)藥(殺蟲劑和殺菌劑)、除莠劑以及石油化工等產(chǎn)品的污染物，并同時對土壤起到修復(fù)作用。

狹義的生物肥料，即指微生物(細(xì)菌)肥料，簡稱菌肥，又稱微生物接種劑。它是由具有特殊效能的微生物經(jīng)過發(fā)酵(人工培制)而成的，含有大量有益微生物，施入土壤后，或能固定空氣中的氮素，或能活化土壤中的養(yǎng)分，改善植物的營養(yǎng)環(huán)境，或在微生物的生命活動過程中，產(chǎn)生活性物質(zhì)，刺激植物生長的特定微生物制品。

廣義的生物肥料泛指利用生物技術(shù)制造的、對作物具有特定肥效(或有肥效又有刺激作用)的生物制劑，其有效成分可以是特定的活生物體、生物體的代謝物或基質(zhì)的轉(zhuǎn)化物等，這種生物體既可以是微生物，也可以是動、植物組織和細(xì)胞。生物肥料與化學(xué)肥料、有機肥料一樣，是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的重要肥源。近年來，由于化學(xué)肥料和化學(xué)農(nóng)藥的大量不合理施用，不僅耗費了大量不可再生的資源，而且破壞了土壤結(jié)構(gòu)，污染了農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)和環(huán)境，影響了人類的健康生存。因此，從現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中倡導(dǎo)的綠色農(nóng)業(yè)、生態(tài)農(nóng)業(yè)的發(fā)展趨勢看，不污染環(huán)境的無公害生物肥料，必將會在未來農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中發(fā)揮重要作用。

按目前微生物肥料的制品和種類來分析。

可以分為兩類:

(1)通過其中所含微生物的生命活動，增加了植物元素營養(yǎng)的供應(yīng)量，包括土壤和生產(chǎn)環(huán)境中植物營養(yǎng)元素的供應(yīng)總量和植物營養(yǎng)元素的有效供應(yīng)量，促使植物營養(yǎng)狀況的改善，進而產(chǎn)量增加，這一類微生物肥料的代表品種是根瘤菌肥料。

(2)其制品雖然也是通過其中所含的微生物生命活動的關(guān)鍵作用促使作物增產(chǎn)，但是其中微生物生 命活動的關(guān)鍵作用不限于提高植物的元素營養(yǎng)供應(yīng)水平，包括了它們所產(chǎn)生的植物生長刺激素對植物的刺激作用，促進植物對營養(yǎng)元素的吸收作用，或者是有拮抗某些病原微生物的致病作用，減輕作物病蟲害而導(dǎo)致產(chǎn)量增加。這類微生物的種類和制品比較多，也比較復(fù)雜。但隨著研究的深入發(fā)展，此類微生物及其制品將會有比較合理、比較科學(xué)的歸屬、分類。